목록

BWA는 어떻게 read를 찾을까?첨단융합과 나의 미래 · 실습1B 부록 2

PPTX

슬라이드

  1. Day 1 심화 · 실습1B 부록 2 — BWA는 어떻게 read를 찾을까?
  2. BWA가 하는 일 — 퍼즐 조각이 그림의 어디에 들어갈까?
  3. ① 꼬리 만들기 — 어떤 위치에서 시작해 끝까지 = 꼬리
  4. ② 왜 꼬리일까? — 찾고 싶은 서열은 어떤 꼬리의 '머리'에 있다
  5. ③ 사전처럼 줄 세우기 — 꼬리를 ABC 순서로 줄 세운다
  6. ④ 사전에서 찾기 — 줄 세워 두면 사전 찾듯 범위를 좁혀 간다
  7. ⑤ 문제 — 사람 유전체로 만들면 꼬리 사전이 너무 크다
  8. ⑥ 해결: 앞 글자 한 줄 — 꼬리마다 '바로 앞 글자' 하나만 적는다
  9. ⑦ 앞 글자로 찾기 — GAG를 뒤에서부터 한 글자씩 붙여 가며 찾는다
  10. ⑧ 없는 서열이면? — 겸상 코돈 GTG는 중간에 끊긴다
  11. ⑨ 변이가 있는 read — 끊긴 양쪽을 따로 찾아서 이어 붙인다
  12. BWA 한눈에 — 미리 색인 → 씨앗 찾기 → 이어 붙이기
  13. 정리 — BWA를 세 문장으로